Пермакултурата се заражда в резултат на работата на Бил Молисън и Дейвид Холмгрен. Биоземеделието е родено от работата на Рудолф Щайнер и духовната наука. И двете са опити за създаване на устойчиви модели на земеделие. Те включват не само начини за качеството на храната, но и на живота. Насърчаване на тяхната собствена система за етика, която се занимава с това как хората се отнасят към Земята и себе си. Био динамичното земеделие е по дефиниция произвеждане на органични продукти за консумация, докато при пермакултурата обикновено цялата система е органична и съвместимо свързана със всички елементи.... Биодинамиката казва "не можете да използвате този тип тор или този метод на контрол на вредителите", докато пермакултурата казва - ако имате проблем защо бихте искали да използвате тези методи? Практиката на пермакултурата е в постоянен процес на преразглеждане на нови идеи, наблюдение и експериментиране, взаимно свързване на елементи като езеро, къща, обор, за да работят като едно цяло, като един организъм следвайки природните закони и дадености.
Биодинамиката има по-голяма структурирана общност по много причини - например, има групи, които проверяват за лиценз на всеки, който иска да продаде "биодинамична" храна - биодинамичното е търговска марка. Има общности, предприятия, които са обвързани с биодинамични движения. Пермакултурата е по-безизвестна, няма големи обществени движения. Има организации, които предлагат пермакултурни дизайнерски курсове, но самата дума permaculture не е запазена марка.
Биодинамиката включва някои идеи, които биха могли да бъдат описани като "мистериозни" или астрологически, въпреки че това е по-скоро малка част от вярванията на движението. Щайнер е бил философ, който се е интересувал от метафизика, и това се пренася към Биодинамиката. Пермакултурата придава работата си повече на екологичния подход и науката, докато по мистични и езотерични въпроси мълчи - някои пермакултуристи може да вярват в това, а други не. Но това не е от голямо значение, тъй като това не е важен въпрос, това е нещо, което всеки индивидуално решава.
"Пермакултурата е като гардероб, а Биодинамиката - като закачалка вътре в нея." (Бил Молисън)